鯤羽生物聯(lián)合創(chuàng)始人在國(guó)際知名期刊Nature Genetics，Science Advances以及Nature Communications發(fā)表系列空間基因組學(xué)研究成果

作者：admin2022-10-24 17:29 熱度：886

鯤羽生物科技有限公司聯(lián)合創(chuàng)始人曹罡教授，林達(dá)博士，以及徐偉澤博士于2022年10月4日在國(guó)際知名期刊Nature Communications上發(fā)表論文，利用單細(xì)胞染色質(zhì)構(gòu)象捕獲技術(shù)sciDLO Hi-C（圖1），系統(tǒng)解析了單核巨噬細(xì)胞在分化與免疫活化過程中染色質(zhì)空間構(gòu)象重塑。這是繼2018年Nature Genetics，2021年Science Advances之后，曹罡教授第三次在國(guó)際知名期刊上發(fā)表空間基因組學(xué)系列研究成果。一系列先進(jìn)技術(shù)的發(fā)表標(biāo)志著鯤羽生物技術(shù)團(tuán)隊(duì)在空間基因組技術(shù)研發(fā)領(lǐng)域進(jìn)入國(guó)際第一方陣。

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圖1：sciDLO Hi-C實(shí)驗(yàn)流程圖（Nature Communications, 2022）

sciDLO Hi-C以曹罡教授與林達(dá)博士前期發(fā)表在Nature Genetics（IF = 41.3）上的DLO Hi-C技術(shù)（圖2）為基礎(chǔ)，引入了“條形碼DNA接頭”和“拆分池”技術(shù)。在文庫構(gòu)建過程中，將組織單細(xì)胞懸液通過多輪的混合與拆分，使每個(gè)細(xì)胞帶上獨(dú)有的標(biāo)簽，然后通過混合測(cè)序，同時(shí)捕獲群體細(xì)胞與群體中單個(gè)細(xì)胞的染色質(zhì)空間構(gòu)象信息。

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圖2：DLO Hi-C實(shí)驗(yàn)流程圖（Nature Genetics, 2018）

利用sciDLO Hi-C，一次實(shí)驗(yàn)可以捕獲高達(dá)1000余個(gè)單細(xì)胞染色質(zhì)空間互作信息，對(duì)發(fā)育生物學(xué)、腫瘤進(jìn)化、以及神經(jīng)生物學(xué)領(lǐng)域有巨大的推動(dòng)作用。Nature Genetics專門發(fā)表評(píng)論文章，對(duì)我們的工作給予高度評(píng)價(jià)（圖3）。鯤羽生物技術(shù)團(tuán)隊(duì)運(yùn)用具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的空間組學(xué)技術(shù)發(fā)現(xiàn)了病毒基因組與宿主基因組跨界互作的空間基因組構(gòu)象，揭示了病原逃逸先天免疫系統(tǒng)清除機(jī)理，發(fā)掘了抗病毒及抗結(jié)核藥物設(shè)計(jì)新靶點(diǎn)。

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